Matthias König als neuer Professor an der Universität zu Lübeck begrüßt

2026-09-01

Matthias König als neuer Professor an der Universität zu Lübeck begrüßt

Matthias König nahm am 1. September 2026 gemeinsam mit anderen neu berufenen Professorinnen und Professoren am Welcome Day der Universität zu Lübeck teil, mit Campusprogramm und Abendempfang.

Publikation: EFECT Enables Reliable and Reproducible Stochastic Simulations Across Disciplines

2026-08-05

Publikation: EFECT Enables Reliable and Reproducible Stochastic Simulations Across Disciplines

Open & FAIR

Wir stellen EFECT vor, den Empirical Characteristic Function Equality Convergence Test, ein universelles statistisches Framework zur Quantifizierung der Reproduzierbarkeit stochastischer Simulationen in Systembiologie, Epidemiologie, Finanzwesen und maschinellem Lernen.

Poster beim HIP Day 2026: Ein PBPK-Modell des Leukotrien-Rezeptor-Antagonisten Montelukast

2026-07-07

Poster beim HIP Day 2026: Ein PBPK-Modell des Leukotrien-Rezeptor-Antagonisten Montelukast

Pharmakometrie

Jessica Cruz Pérez stellt ihr Praktikumsprojekt vor, in dem sie ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches (PBPK) Modell von Montelukast entwickelt, um die interindividuelle Variabilität der Pharmakokinetik zu untersuchen, einschließlich der Effekte des...

Preprint: A Physiologically Based Pharmacokinetic/Pharmacodynamic Model of the Diuretic Hydrochlorothiazide

2026-07-06

Preprint: A Physiologically Based Pharmacokinetic/Pharmacodynamic Model of the Diuretic Hydrochlorothiazide

Pharmakometrie

Wir präsentieren ein Ganzkörper-PBPK/PD-Modell des Diuretikums Hydrochlorothiazid zur Untersuchung der pharmakokinetischen und pharmakodynamischen Variabilität bei hypertensiven Patientinnen und Patienten, mit Fokus auf renale, hepatische und kardiale Beeinträchtigungen.

Poster beim PAGE 2026: PK-DB 2.0 für pharmakometrische Modellierung, KI und digitale Zwillinge

2026-06-04

Poster beim PAGE 2026: PK-DB 2.0 für pharmakometrische Modellierung, KI und digitale Zwillinge

Pharmakometrie Digitale Zwillinge Open & FAIR

Wir präsentieren PK-DB 2.0, eine offene, FAIR und KI-taugliche Datenbank für Pharmakokinetik und Pharmakodynamik, die kuratierte PK/PD-Daten aus mehr als 700 klinischen Studien für pharmakometrische Modellierung, maschinelles Lernen und die...

Preprint: An Open and Reproducible Digital Twin for Personalised Anticoagulant Therapy

2026-05-06

Preprint: An Open and Reproducible Digital Twin for Personalised Anticoagulant Therapy

Pharmakometrie Digitale Zwillinge

Wir präsentieren einen offenen Ganzkörper-PBPK/PD-digitalen Zwilling von Apixaban zur Untersuchung der pharmakokinetischen und pharmakodynamischen Variabilität in der personalisierten Antikoagulanzientherapie, mit Fokus auf renale und hepatische Beeinträchtigung, Nahrungsaufnahme, Körpergewicht, Metaboliten und...

Automated Segmentation of Hepatic Vessels and Lobules in Whole-Slide Images Using U-Net Models

2026-04-30

Automated Segmentation of Hepatic Vessels and Lobules in Whole-Slide Images Using U-Net Models

Digitale Pathologie

Unsere neueste Publikation stellt eine Deep-Learning-Pipeline zur automatisierten Segmentierung hepatischer Gefäße, Gallengänge und Läppchen in Ganzschnittbildern der Leberhistologie vor.

Masterarbeit Antonio Alvarez

2026-04-23

Masterarbeit Antonio Alvarez

Open & FAIR

Antonio Alvarez reichte seine Masterarbeit zu reproduzierbarer Bayes'scher Optimierung und Unsicherheitsquantifizierung in pharmakokinetischen Modellen ein

Preprint: A Digital Twin of Empagliflozin Pharmacokinetics and Pharmacodynamics

2026-03-20

Preprint: A Digital Twin of Empagliflozin Pharmacokinetics and Pharmacodynamics

Pharmakometrie Digitale Zwillinge

Wir präsentieren einen Ganzkörper-PBPK/PD-digitalen Zwilling von Empagliflozin zur Untersuchung der pharmakokinetischen und pharmakodynamischen Variabilität bei Typ-2-Diabetes mellitus, mit Fokus auf renale und hepatische Beeinträchtigung, Metabolitenexposition und dosisabhängige Effekte.

Keynote: Digitale Zwillinge und Dashboards für die personalisierte Arzneimitteltherapie

2026-03-12

Keynote: Digitale Zwillinge und Dashboards für die personalisierte Arzneimitteltherapie

Digitale Zwillinge KI

Beim Patient Monitoring Roundtable (PMRT) an der Charité – Universitätsmedizin Berlin habe ich vorgestellt, wie digitale Zwillinge und interaktive Dashboards die personalisierte Arzneimitteltherapie und klinische Entscheidungsfindung unterstützen können.

Preprint: A Digital Twin of Canagliflozin Pharmacokinetics and Pharmacodynamics in Type 2 Diabetes Mellitus

2026-01-27

Preprint: A Digital Twin of Canagliflozin Pharmacokinetics and Pharmacodynamics in Type 2 Diabetes Mellitus

Pharmakometrie Digitale Zwillinge

Wir präsentieren einen Ganzkörper-PBPK/PD-digitalen Zwilling von Canagliflozin zur Untersuchung der pharmakokinetischen und pharmakodynamischen Variabilität bei Typ-2-Diabetes mellitus, mit Fokus auf renale und hepatische Beeinträchtigung, Metabolitenexposition und dosisabhängige Effekte.

Interview: Modelle so komplex wie der Körper selbst – Digitale Zwillinge in der Medizin

2026-01-30

Interview: Modelle so komplex wie der Körper selbst – Digitale Zwillinge in der Medizin

Digitale Zwillinge

In einem Interview mit Matthias König beleuchtet die Gesellschaft für Informatik, wie digitale Zwillinge so komplex werden wie der menschliche Körper selbst und wie sie personalisierte Vorhersage, Simulation und Entscheidungsunterstützung...

Erfolgreicher Open Science Workshop 2025

2025-11-28

Erfolgreicher Open Science Workshop 2025

Open & FAIR

Der Open Science Workshop 2025 brachte Teilnehmende aus der gesamten Berlin University Alliance für eine eintägige, praxisorientierte Einführung in reproduzierbare Forschung, FAIR-Daten und Open-Source-Workflows zusammen.

Abschluss des KI-Lehrzertifikats

2025-11-20

Abschluss des KI-Lehrzertifikats

Erfolgreicher Abschluss des KI-Lehrzertifikats (200 AE) an der Humboldt-Universität zu Berlin, das Grundlagen der KI, Ethik und Hochschuldidaktik im Rahmen von KI-Campus 2.0 und der AI Skills Initiative umfasst.

Humboldt Internship Program 2026 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung mit digitalen Zwillingen – Ein systemmedizinischer Ansatz

2025-11-13

Humboldt Internship Program 2026 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung mit digitalen Zwillingen – Ein systemmedizinischer Ansatz

Digitale Zwillinge

Wir bieten Praktika im Jahr 2026 an, dreimonatige akademische Forschungsaufenthalte an der Humboldt-Universität zu Berlin. Die Bewerbung für die Summer Term Internships 2026 ist vom 5. November bis 18. Dezember...

A Digital Twin of Dapagliflozin Pharmacokinetics and Pharmacodynamics in Type 2 Diabetes Mellitus

2025-11-13

A Digital Twin of Dapagliflozin Pharmacokinetics and Pharmacodynamics in Type 2 Diabetes Mellitus

Pharmakometrie Digitale Zwillinge

Wir präsentieren einen physiologiebasierten PBPK/PD-digitalen Zwilling von Dapagliflozin zur Analyse der pharmakokinetischen und pharmakodynamischen Variabilität bei Typ-2-Diabetes mellitus, mit Fokus auf Dosierung, hepatorenale Beeinträchtigung und Nahrungseffekte.

Faces of the Berlin University Alliance

2025-11-01

Faces of the Berlin University Alliance

Ich fühle mich sehr geehrt, in der neuen Filmreihe vertreten zu sein, die anlässlich des 6. Jubiläums der Berlin University Alliance (BUA) gestartet wurde. Sehen Sie mein Kurzporträt: 🎥. Erfahren...

Digitaler Zwilling von Losartan für die präzise Blutdrucktherapie

2025-10-14

Digitaler Zwilling von Losartan für die präzise Blutdrucktherapie

Pharmakometrie Digitale Zwillinge

Wir stellen ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK/PD) Modell von Losartan und seinem aktiven Metaboliten E3174 als digitalen Zwilling vor, um die Variabilität der Blutdruckregulation zu untersuchen und eine individualisierte antihypertensive Therapie...

COMBINE & RDA: Reproducibility by Design: Data and Workflows for Pharmacokinetic Digital Twins

2025-10-20

COMBINE & RDA: Reproducibility by Design: Data and Workflows for Pharmacokinetic Digital Twins

Digitale Zwillinge Pharmakometrie Open & FAIR

Präsentation bei COMBINE2025 und der RDA-Versammlung unseres Ansatzes für reproduzierbare digitale Zwillinge.

Digitaler Zwilling von Glimepirid ermöglicht personalisierte Diabetestherapie

2025-10-08

Digitaler Zwilling von Glimepirid ermöglicht personalisierte Diabetestherapie

Pharmakometrie Digitale Zwillinge

Wir präsentieren einen digitalen pharmakokinetischen Zwilling von Glimepirid, der simuliert, wie patientenspezifische Faktoren das Arzneimittelverhalten beeinflussen, und damit eine individualisierte und stratifizierte Behandlung von Typ-2-Diabetes unterstützt.

Assessing the Impact of AI and Digital Twins on Clinical Decision-Making in Hepatology and Hepatobiliary Surgery

2025-09-15

Assessing the Impact of AI and Digital Twins on Clinical Decision-Making in Hepatology and Hepatobiliary Surgery

Digitale Zwillinge KI

Unser neuester Preprint präsentiert die Ergebnisse einer Befragungsstudie darüber, wie Klinikerinnen und Kliniker in Hepatologie und hepatobiliärer Chirurgie künstliche Intelligenz (KI) und digitale Zwillinge in der klinischen Entscheidungsfindung wahrnehmen, und...

Dr. Matthias König schließt Leadership-Zertifikat erfolgreich ab

2025-08-15

Dr. Matthias König schließt Leadership-Zertifikat erfolgreich ab

Dr. Matthias König hat das umfassende Leadership-Zertifikat der Berlin Leadership Academy erfolgreich abgeschlossen und damit seine Führungskompetenzen für die Leitung von Forschungsteams und die Förderung effektiver Zusammenarbeit in der Wissenschaft...

Bachelorarbeit Ennie Tensil: Physiologiebasierte pharmakokinetische/pharmakodynamische Modellierung von Losartan

2025-07-15

Bachelorarbeit Ennie Tensil: Physiologiebasierte pharmakokinetische/pharmakodynamische Modellierung von Losartan

Pharmakometrie

Diese Arbeit präsentiert ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK/PD) Modell von Losartan und seinem Metaboliten E3174, das mechanistische Einblicke liefert, wie physiologische und genetische Faktoren die Therapie beeinflussen, und individualisierte Dosierungsstrategien unterstützt.

Ein systempharmakologischer Ansatz für Rivaroxaban: Physiologiebasierte Modellierung von Pharmakokinetik und Gerinnungsdynamik

2025-07-14

Ein systempharmakologischer Ansatz für Rivaroxaban: Physiologiebasierte Modellierung von Pharmakokinetik und Gerinnungsdynamik

Pharmakometrie

Unser neuester Preprint stellt ein umfassendes physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK/PD) Modell von Rivaroxaban vor, das die Simulation von Absorption, Verteilung, Metabolismus, Ausscheidung und Gerinnungsdynamik des Arzneimittels unter verschiedenen klinischen Bedingungen ermöglicht.

Humboldt Internship Program Day 2025: Projektbericht & Podiumsdiskussion

2025-07-07

Humboldt Internship Program Day 2025: Projektbericht & Podiumsdiskussion

Pharmakometrie

Isabella Tan, Olivia Yau und Minjun Kim stellten am Program Day hier an der Humboldt-Universität zu Berlin ihre PBPK/PD-Modellierungsprojekte zu GLP-1-Agonisten vor.

Neues PBPK/PD-Modellierungsprojekt: Rapamycin als Fallstudie für personalisierte immunsuppressive Therapie

2025-07-02

Neues PBPK/PD-Modellierungsprojekt: Rapamycin als Fallstudie für personalisierte immunsuppressive Therapie

Pharmakometrie Digitale Zwillinge

Monika Jesionek hat ein neues ERASMUS-Projekt gestartet, um ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK/PD) Modell von Rapamycin zu entwickeln, mit dem Ziel, die interindividuelle Variabilität besser zu verstehen und die Entwicklung eines...

Digitaler Zwilling von Glimepirid ermöglicht personalisierte Diabetestherapie

2025-06-17

Digitaler Zwilling von Glimepirid ermöglicht personalisierte Diabetestherapie

Pharmakometrie Digitale Zwillinge

Wir präsentieren einen digitalen pharmakokinetischen Zwilling von Glimepirid, der simuliert, wie patientenspezifische Faktoren das Arzneimittelverhalten beeinflussen, und damit eine individualisierte und stratifizierte Behandlung von Typ-2-Diabetes unterstützt.

Bachelorarbeit Nike Nemitz: Physiologiebasierte pharmakokinetische/pharmakodynamische Modellierung von Dapagliflozin

2025-06-15

Bachelorarbeit Nike Nemitz: Physiologiebasierte pharmakokinetische/pharmakodynamische Modellierung von Dapagliflozin

Pharmakometrie

In dieser Bachelorarbeit wurde ein PBPK/PD-Modell von Dapagliflozin entwickelt, um zu untersuchen, wie physiologische und externe Faktoren wie hepatorenale Beeinträchtigung und Nahrungsaufnahme das Arzneimittelverhalten und die therapeutische Wirksamkeit bei der...

Reflexionen zur Inklusion im Forschungsdesign

2025-06-12

Reflexionen zur Inklusion im Forschungsdesign

Dr. Matthias König nahm an einer interdisziplinären Podiumsdiskussion des Berlin University Alliance Fellows Club teil, um zu erörtern, wie inklusives Design die Forschung über verschiedene Fachbereiche hinweg beeinflusst. Die Veranstaltung...

Kurs abgeschlossen: Pharmakokinetische/pharmakodynamische Modellierung

2025-06-12

Kurs abgeschlossen: Pharmakokinetische/pharmakodynamische Modellierung

Pharmakometrie

Vom 3. bis 6. Juni haben wir unseren neu konzipierten Kurs zur pharmakokinetischen/pharmakodynamischen (PK/PD) Modellierung erfolgreich durchgeführt. Entwickelt im Rahmen des Digital Health Profession Educator (DHPE) Programms, legte der Kurs...

SPP-Startfinanzierung für webbasiertes FEM-Visualisierungstool bewilligt

2025-05-10

SPP-Startfinanzierung für webbasiertes FEM-Visualisierungstool bewilligt

Open & FAIR

Matthias König erhielt eine Startfinanzierung in Höhe von 15.000 € aus dem DFG-Schwerpunktprogramm SPP2311 zur Entwicklung von SPP-FEMVis, einer webbasierten Visualisierungsplattform für Finite-Elemente-Methode-(FEM)-Simulationen zur Unterstützung von Open Science und interdisziplinärer...

Algonomy beim Festival della Robotica 2025: KI und digitale Zwillinge für die Leberchirurgie

2025-05-10

Algonomy beim Festival della Robotica 2025: KI und digitale Zwillinge für die Leberchirurgie

Digitale Zwillinge KI

Beim Festival della Robotica 2025 in Pisa stellte Mariia Myshkina unsere Forschung aus dem Algonomy-Projekt vor und zeigte, wie KI und digitale Zwillinge die Entscheidungsfindung in der hepatobiliären Chirurgie unterstützen...

Neue Projekte gestartet: Modellierung von GLP-1-Agonisten und Optimierung der Anästhesiesteuerung

2025-05-10

Neue Projekte gestartet: Modellierung von GLP-1-Agonisten und Optimierung der Anästhesiesteuerung

Wir freuen uns, neue Forschungsprojekte in unserer Gruppe bekannt zu geben, die sich auf personalisierte Behandlungsstrategien für Diabetes und ein verbessertes Anästhesiemanagement durch Rechenmodelle und Regelungssysteme konzentrieren.

Interview: Matthias König über Reproduzierbarkeit, Open Science und die Zukunft der biologischen Forschung

2025-04-30

Interview: Matthias König über Reproduzierbarkeit, Open Science und die Zukunft der biologischen Forschung

Open & FAIR

In einem Interview für die Berlin University Alliance spricht Matthias König über die Reproduzierbarkeitskrise in der Biologie und das transformative Potenzial von Open Science. Als BUA Open Science Ambassador betont...

Bachelorarbeit Michelle Elias: PBPK-Modellierung von Glimepirid: Untersuchung der Variabilität in der Typ-2-Diabetes-Behandlung

2025-04-15

Bachelorarbeit Michelle Elias: PBPK-Modellierung von Glimepirid: Untersuchung der Variabilität in der Typ-2-Diabetes-Behandlung

Pharmakometrie

Michelle Elias hat ihre Bachelorarbeit zu einem physiologiebasierten pharmakokinetischen (PBPK) Modell von Glimepirid erfolgreich abgeschlossen, mit Fokus auf interindividuelle Variabilität, hepatorenale Beeinträchtigung und Pharmakogenomik.

SBML-Editor

2025-04-01

SBML-Editor

Open & FAIR

Matthias König wurde für die Amtszeit 2025–2027 zum SBML-Editor gewählt.

Featured Fellow - Berlin University Alliance (BUA) - Matthias König

2025-04-02

Featured Fellow - Berlin University Alliance (BUA) - Matthias König

Als Featured BUA Fellow an der Humboldt-Universität treibt Matthias König die digitale Medizin und Systembiologie an der Schnittstelle von Daten, Modellierung und klinischer Forschung voran.

Preprint: From FAIR to CURE: Guidelines for Computational Models of Biological Systems

2025-02-21

Preprint: From FAIR to CURE: Guidelines for Computational Models of Biological Systems

Open & FAIR

Unser neuester Preprint, From FAIR to CURE: Guidelines for Computational Models of Biological Systems, stellt die CURE-Prinzipien - Credible, Understandable, Reproducible und Extensible - als Rahmenwerk zur Verbesserung von Entwicklung...

König Lab bei der EP PerMed Conference on Personalised Medicine Research

2025-02-12

König Lab bei der EP PerMed Conference on Personalised Medicine Research

Wir freuen uns, bekannt zu geben, dass Mariia Myshkina, Elisabetta Casabianca und Matthias König an der EP PerMed Conference on Personalised Medicine Research teilnahmen, die vom 11. bis 12. Februar...

Start eines neuen Forschungspraktikums in der PBPK/PD-Modellierung

2025-01-20

Start eines neuen Forschungspraktikums in der PBPK/PD-Modellierung

Pharmakometrie

PBPK/PD-Modellentwicklung für das direkte orale Antikoagulans Rivaroxaban

Start eines neuen Forschungspraktikums in der PBPK/PD-Modellierung

2025-01-07

Start eines neuen Forschungspraktikums in der PBPK/PD-Modellierung

Pharmakometrie

PBPK-Modellentwicklung für Tirzepatid in der Diabetes- und Adipositasbehandlung

Circle U. finanziert AlgoNomy zur Bekämpfung von digitalem Paternalismus in der KI-gestützten Gesundheitsversorgung

2024-12-20

Circle U. finanziert AlgoNomy zur Bekämpfung von digitalem Paternalismus in der KI-gestützten Gesundheitsversorgung

KI

Circle U. hat AlgoNomy: Advancing Doctor-Patient Autonomy in AI-Driven Healthcare finanziert, ein gemeinschaftliches Projekt, das sich mit digitalem Paternalismus befasst - bei dem Algorithmen Entscheidungen im Gesundheitswesen dominieren, anstatt menschliche...

Humboldt Internship Program 2025 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung - Ein systemmedizinischer Ansatz

2024-10-01

Humboldt Internship Program 2025 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung - Ein systemmedizinischer Ansatz

Wir bieten Praktika im Jahr 2025 an, dreimonatige akademische Forschungsaufenthalte an der Humboldt-Universität zu Berlin. Die Bewerbung für die Summer Term Internships 2025 ist vom 11. November bis 20. Dezember...

Start von zwei neuen Forschungsprojekten in der PBPK/PD-Modellierung

2024-08-30

Start von zwei neuen Forschungsprojekten in der PBPK/PD-Modellierung

Pharmakometrie

Ennie Tensil und Michelle Elias starten Bachelorprojekte zu Losartan und Glimepirid

Masterarbeit Jonas Küttner

2024-08-28

Masterarbeit Jonas Küttner

Digitale Pathologie

Jonas Küttner reichte seine Masterarbeit ein, in der er einen Workflow für die Bildanalyse in der Leber entwickelte

Open Science Ambassador der BUA

2024-08-08

Open Science Ambassador der BUA

Open & FAIR

Stolz darauf, 2024 als Open Science Ambassador der Berlin University Alliance (BUA) ausgewählt worden zu sein.

Teilnahme am DHPE

2024-07-18

Teilnahme am DHPE

Matthias König für das Digital Health Professions Educator (DHPE) Program ausgewählt

Humboldt Internship Program (HIP) Konferenz

2024-07-18

Humboldt Internship Program (HIP) Konferenz

Stolz auf die Teilnahme am Humboldt Internship Program 2024. Großartige Arbeit von Vera, Deepa und Prerna.

Abschließendes Ecosystem Meeting von EDITH zum Aufbau des VHT

2024-07-15

Abschließendes Ecosystem Meeting von EDITH zum Aufbau des VHT

Stolz auf die Teilnahme am abschließenden Ecosystem Meeting von EDITH zum Aufbau des Virtual Human Twin (VHT) in Amsterdam.

Neues Projekt: Vera Tereshchuk startet SGLT2-PBPK-Modellierungsprojekt

2024-07-01

Neues Projekt: Vera Tereshchuk startet SGLT2-PBPK-Modellierungsprojekt

Pharmakometrie

Vera Tereshchuk wird ein PBPK-Modell für Canagliflozin entwickeln, um das Verständnis von Pharmakokinetik und Pharmakodynamik bei Diabetes zu verbessern.

PAGE2024: Präsentation unserer Forschung in Rom

2024-06-25

PAGE2024: Präsentation unserer Forschung in Rom

Mariia Myshkina und Matthias König präsentierten unsere Modellierungsergebnisse zu Captopril beim PAGE2024-Treffen (Population Approach Group Europe) in Rom.

Bachelorarbeit Afruja Hossain

2024-06-09

Bachelorarbeit Afruja Hossain

Afruja Hossain schloss ihre Bachelorarbeit zur Entwicklung einer Datenbank von CYP- und UGT-Enzymen ab

Erfolgreicher Abschluss des einwöchigen Kurses zur pharmakokinetischen Modellierung

2024-06-07

Erfolgreicher Abschluss des einwöchigen Kurses zur pharmakokinetischen Modellierung

Pharmakometrie

Wir freuen uns, den erfolgreichen Abschluss unseres einwöchigen Intensivkurses zur pharmakokinetischen Modellierung bekannt zu geben, in dem sich Studierende mit Grundprinzipien, Arzneimittelverteilung, Clearance, Elimination und verschiedenen Modellierungstechniken zur Verbesserung von...

Start eines neuen Projekts über das Humboldt Internship Program (HIP): PK-LLM von Prerna Parakkat

2024-05-23

Start eines neuen Projekts über das Humboldt Internship Program (HIP): PK-LLM von Prerna Parakkat

Pharmakometrie KI

Wir freuen uns, den Start eines neuen Projekts von Prerna Parakkat im Rahmen des Humboldt Internship Program (HIP) bekannt zu geben. Prerna wird an PK-LLM: Implementing a Large Language Model...

Publikation: Cross-Species Variability in Lobular Geometry and Cytochrome P450 Hepatic Zonation: Insights into CYP1A2, CYP2E1, CYP2D6 and CYP3A4

2024-05-16

Publikation: Cross-Species Variability in Lobular Geometry and Cytochrome P450 Hepatic Zonation: Insights into CYP1A2, CYP2E1, CYP2D6 and CYP3A4

Digitale Pathologie

Unsere neueste Publikation zu „Cross-Species Variability in Lobular Geometry & Cytochrome P450 Hepatic Zonation“ liefert Einblicke in die Leberfunktion über verschiedene Spezies hinweg mittels WSI-Technologie.

Neue Projekte: Nike Nemitz und Yusuf Ali Kulanoglu starten PBPK-Modellierungsprojekte

2024-04-15

Neue Projekte: Nike Nemitz und Yusuf Ali Kulanoglu starten PBPK-Modellierungsprojekte

Pharmakometrie

Nike Nemitz und Yusuf Ali Kulanoglu werden PBPK-Modelle für Dapagliflozin beziehungsweise Aliskiren entwickeln, mit dem Ziel, das Verständnis von Pharmakokinetik und Pharmakodynamik in der Diabetes- und Herz-Kreislauf-Behandlung zu verbessern.

Publikation: The Simulation Experiment Description Markup Language (SED-ML): Language Specification for Level 1 Version 5

2024-04-15

Publikation: The Simulation Experiment Description Markup Language (SED-ML): Language Specification for Level 1 Version 5

Open & FAIR

Level 1 Version 5 von SED-ML verbessert die Möglichkeit, computergestützte Simulationsexperimente zu annotieren, zu archivieren, zu teilen und zu reproduzieren, indem es Modelliererinnen und Modellierern erlaubt, Tasks, Modelländerungen, Wertebereiche und...

Masterarbeit Shubhankar Palwankar

2024-05-05

Masterarbeit Shubhankar Palwankar

Pharmakometrie

Shubhankar Palwankar verteidigte seine Masterarbeit zur Entwicklung eines PBPK-Modells von Enalapril

Neues multiskaliges Lebermodell enthüllt Zonierungs-Funktions-Dynamiken bei arzneimittelinduzierter Leberschädigung (DILI).

2024-03-29

Neues multiskaliges Lebermodell enthüllt Zonierungs-Funktions-Dynamiken bei arzneimittelinduzierter Leberschädigung (DILI).

Digitale Pathologie Digitale Zwillinge

Wir freuen uns, den Preprint unserer neuesten Forschungsarbeit bekannt zu geben, „Simulation of zonation-function relationships in the liver using coupled multiscale models: Application to drug-induced liver injury“. Diese Studie stellt...

PBPK-Modell von Morphin - Projekt

2024-03-01

PBPK-Modell von Morphin - Projekt

Pharmakometrie

Start eines neuen Praktikumsprojekts: Entwicklung eines physiologiebasierten pharmakokinetischen Modells von Morphin. Deepa wird, unterstützt von Rohini und Rohit, ein PBPK-Modell von Morphin entwickeln.

Mariia Myshkina hat ihre Promotion im ATLAS-Projekt begonnen.

2024-02-01

Mariia Myshkina hat ihre Promotion im ATLAS-Projekt begonnen.

Digitale Zwillinge KI

Wir begrüßen Mariia in unserem Team, die im Rahmen von ATLAS an der computergestützten Modellierung der Leber arbeiten wird.

Teilnahme am ersten EDITH-CSA Ecosystem Meeting - Advancing the Virtual Human Twin

2024-01-18

Teilnahme am ersten EDITH-CSA Ecosystem Meeting - Advancing the Virtual Human Twin

Wir nahmen am ersten EDITH-CSA 'Ecosystem meeting on building the Virtual Human Twin' teil, das am 18. und 19. Januar 2024 an der École Polytechnique in Paris stattfand.

Preprint: Cross-Species Variability in Lobular Geometry and Cytochrome P450 Hepatic Zonation: Insights into CYP1A2, CYP2E1, CYP2D6 and CYP3A4

2023-12-29

Preprint: Cross-Species Variability in Lobular Geometry and Cytochrome P450 Hepatic Zonation: Insights into CYP1A2, CYP2E1, CYP2D6 and CYP3A4

Digitale Pathologie

Unser neuester Preprint zu „Cross-Species Variability in Lobular Geometry & Cytochrome P450 Hepatic Zonation“ liefert Einblicke in die Leberfunktion über verschiedene Spezies hinweg mittels WSI-Technologie.

Eleven Strategies for Making Reproducible Research and Open Science Training the Norm at Research Institutions

2023-11-03

Eleven Strategies for Making Reproducible Research and Open Science Training the Norm at Research Institutions

Open & FAIR

Wir freuen uns, unsere neueste Publikation in eLife bekannt zu geben, die einen Fahrplan für die Integration von reproduzierbarer Forschung und Open-Science-Praktiken in die akademische Arbeit bietet.

Your Dietary Digital Twin (DDtwin)

2023-11-03

Your Dietary Digital Twin (DDtwin)

Digitale Zwillinge

Fortschritte in der Präzisionsernährung: Erfolgreicher Workshop zum Dietary Digital Twin, einem Workshop in Leiden vom 30. Oktober bis 3. November 2023.

Humboldt Internship Program 2024 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung - Ein systemmedizinischer Ansatz

2023-10-31

Humboldt Internship Program 2024 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung - Ein systemmedizinischer Ansatz

Wir bieten Praktika im Jahr 2024 an, dreimonatige akademische Forschungsaufenthalte an der Humboldt-Universität zu Berlin. Die Bewerbung für die Summer Term Internships 2024 ist vom 3. November bis 10. Dezember...

e:Med Meeting 2023 on Systems Medicine: Quantifying Fat Zonation in Liver Lobules: An Integrated Multiscale In-silico Model

2023-10-10

e:Med Meeting 2023 on Systems Medicine: Quantifying Fat Zonation in Liver Lobules: An Integrated Multiscale In-silico Model

Digitale Pathologie Digitale Zwillinge

Wir präsentierten erfolgreich unsere Forschung zu reproduzierbaren digitalen Zwillingen für die personalisierte Leberfunktionsbewertung beim e:Med Meeting 2023 on Systems Medicine.

Preprint: Quantifying Fat Zonation in Liver Lobules: An Integrated Multiscale In-silico Model

2023-09-18

Preprint: Quantifying Fat Zonation in Liver Lobules: An Integrated Multiscale In-silico Model

Digitale Pathologie

Unser neuester Preprint ist jetzt verfügbar: Ein integriertes multiskaliges Modell zur Quantifizierung der Fettzonierung in Leberläppchen.

Hannah Menghis von der Brown University beginnt ihr Praktikum

2023-08-28

Hannah Menghis von der Brown University beginnt ihr Praktikum

Pharmakometrie

Wir begrüßen Hannah Menghis, die ein PBPK-Modell von Semaglutid erstellen wird.

A pathway model of glucose-stimulated insulin secretion in the pancreatic β-cell

2023-08-02

A pathway model of glucose-stimulated insulin secretion in the pancreatic β-cell

KI

Unsere neueste Publikation ist jetzt in Frontiers of Endocrinology erschienen: A pathway model of glucose-stimulated insulin secretion in the pancreatic β-cell

Bachelorarbeit Beatrice Stemmer Mallol

2023-07-17

Bachelorarbeit Beatrice Stemmer Mallol

Pharmakometrie

Beatrice Stemmer Mallol reichte ihre Bachelorarbeit zur Entwicklung eines PBPK-Modells von Talinolol ein

Promotionsverteidigung von Jan Grzegorzewski

2023-07-07

Promotionsverteidigung von Jan Grzegorzewski

Pharmakometrie

Jan Grzegorzewski verteidigte seine Doktorarbeit zur physiologiebasierten pharmakokinetischen Modellierung (PBPK) für dynamische Leberfunktionstests und die Phänotypisierung von Cytochrom P450 (CYP).

Xenia Petukhova und Zahra Bahri starten das Humboldt Internship Program

2023-07-01

Xenia Petukhova und Zahra Bahri starten das Humboldt Internship Program

Humboldt Internship Program 2023 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung - Ein systemmedizinischer Ansatz

Keynote: Advancing Liver Function Assessment: Personalized and Stratified Approaches with Standardized Computational Models and Data

2023-06-16

Keynote: Advancing Liver Function Assessment: Personalized and Stratified Approaches with Standardized Computational Models and Data

Digitale Zwillinge Open & FAIR

Keynote-Vortrag beim Workshop on Computational Models in Biology and Medicine 2023, organisiert von Nicole Radde und Sebastian Höpfl.

Preprint: Eleven Strategies for Making Reproducible Research and Open Science Training the Norm at Research Institutions

2023-05-28

Preprint: Eleven Strategies for Making Reproducible Research and Open Science Training the Norm at Research Institutions

Open & FAIR

Wir stellen 11 Strategien vor, um #OpenScience und #ReproducibleResearch zum Standard an Forschungseinrichtungen zu machen, mit Tipps zur Umsetzung und Ressourcen. Lassen Sie uns gemeinsam dafür sorgen, dass diese Praktiken...

Preprint: A physiologically based pharmacokinetic model for CYP2E1 phenotyping via chlorzoxazone

2023-04-16

Preprint: A physiologically based pharmacokinetic model for CYP2E1 phenotyping via chlorzoxazone

Pharmakometrie

Unser neuester Preprint ist jetzt auf bioRxiv verfügbar: A physiologically based pharmacokinetic model for CYP2E1 phenotyping via chlorzoxazone

Michael Stifel Price zur Förderung interdisziplinärer, datengetriebener Forschung

2023-04-03

Michael Stifel Price zur Förderung interdisziplinärer, datengetriebener Forschung

M. Albadry, S. Höpfl und M. König gewannen den QuaLiPerF Michael Stifel Price für interdisziplinäre, datengetriebene Forschung.

Publikation: Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2022 and the COMBINE meeting 2022

2023-03-29

Publikation: Specifications of standards in systems and synthetic biology: status and developments in 2022 and the COMBINE meeting 2022

Open & FAIR

Unser Überblick über Spezifikationen in der System- und synthetischen Biologie mit einem kurzen Überblick über die COMBINE 2022 ist verfügbar.

Preprint: A consensus model of glucose-stimulated insulin secretion in the pancreatic beta-cell

2023-03-13

Preprint: A consensus model of glucose-stimulated insulin secretion in the pancreatic beta-cell

KI

Unser neuester Preprint ist jetzt auf bioRxiv verfügbar: A consensus model of glucose-stimulated insulin secretion in the pancreatic beta-cell

PBPK-Modellierung von Sorafenib und Gd-EOB-DTPA

2023-02-12

PBPK-Modellierung von Sorafenib und Gd-EOB-DTPA

Pharmakometrie

Frances Okibedi und Narudeem Sojimade werden Modelle des Krebsmedikaments Sorafenib bei HCC sowie des Leberkontrastmittels Gd-EOB-DTPA entwickeln.

X-Research Group - Digitale Zwillinge für die Behandlung von Hypertonie

2023-02-12

X-Research Group - Digitale Zwillinge für die Behandlung von Hypertonie

Digitale Zwillinge

M. König erhält Förderung der Berlin University Alliance und der DFG für die X-Student Research Group: Digitale Zwillinge für die Behandlung von Hypertonie

M. König wurde zum PEtab-Editor gewählt (2023-2026)

2023-02-07

M. König wurde zum PEtab-Editor gewählt (2023-2026)

Open & FAIR

Stolz darauf, zum Editor für PEtab gewählt worden zu sein, ein Datenformat zur Spezifikation von Parameterschätzproblemen in der Systembiologie.

Preprint: Simvastatin therapy in different subtypes of hypercholesterolemia

2023-02-03

Preprint: Simvastatin therapy in different subtypes of hypercholesterolemia

Pharmakometrie

Unser neuester Preprint ist jetzt auf medRxiv verfügbar: Simvastatin therapy in different subtypes of hypercholesterolemia - a physiologically based modelling approach.

ATLAS - AI and Simulation for Tumor Liver ASsessment

2023-02-01

ATLAS - AI and Simulation for Tumor Liver ASsessment

Digitale Zwillinge KI

Das BMBF fördert unser Verbundprojekt ATLAS im Rahmen von „Computational Life Sciences - AI Methods for Systems Medicine“.

Neue Bachelorstudentin - Afruja Hossain

2022-11-17

Neue Bachelorstudentin - Afruja Hossain

Afruja Hossain begann in unserem Labor mit der Arbeit an einem systematischen Überblick über die Proteinvariabilität von Cytochrom-P450-(CYP450)-Isoformen in der menschlichen Leber.

Besuch des EU-Parlaments und Teilnahme an der STOA-KI-Sitzung

2022-11-15

Besuch des EU-Parlaments und Teilnahme an der STOA-KI-Sitzung

Wir wurden ausgewählt, an einer europäischen Politikreise der Berlin University Alliance (BUA) zum Thema EU-Forschungsförderung und Wissenschaftskommunikation teilzunehmen.

Humboldt Internship Program 2023 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung - Ein systemmedizinischer Ansatz

2022-10-26

Humboldt Internship Program 2023 - Computergestützte Modellierung der Arzneimittelentgiftung - Ein systemmedizinischer Ansatz

Wir bieten Praktika im Jahr 2023 an, Bewerbung vom 1. November bis 9. Dezember 2022 möglich.

Dextromethorphan-Publikation

2022-10-24

Dextromethorphan-Publikation

Pharmakometrie

Wie beeinflusst der CYP2D6-Genotyp die metabolische Phänotypisierung? Antworten liefert unser neuester Artikel in Frontiers in Pharmacology.

X-Research Group

2022-10-24

X-Research Group

M. König erhält Förderung der Berlin University Alliance und der DFG für die X-Student Research Group: Physiologiebasierte Modellierung von Arzneimitteln: ACE-Hemmer

COMBINE 2022

2022-10-06

COMBINE 2022

Open & FAIR

Wir organisierten dieses Jahr die Tagung des Computational Modeling in Biology Network (COMBINE) in Berlin mit über 100 Teilnehmenden vom 6. bis 8. Oktober 2022.

ICSB 2022 - Vortrag und Poster

2022-10-10

ICSB 2022 - Vortrag und Poster

Pharmakometrie

Wir konnten unsere Arbeit zur physiologiebasierten pharmakokinetischen (PBPK) Modellierung bei der ICSB2022 präsentieren.