Monika entwickelt ein PBPK-Modell des Immunsuppressivums Rapamycin (Sirolimus) im Rahmen unseres Beitrags zum Immune Digital Twin (IDT).

Juan Pablo entwickelt ein Closed-Loop-Regelsystem zur Optimierung der Anästhesieverabreichung mit dem Ziel, die Präzision und die Patientensicherheit während chirurgischer Eingriffe zu verbessern.

Ennie entwickelt ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK) Modell des direkten Angiotensin-II-Rezeptor-(ARB)-Hemmers Losartan. Ziel ist es, unser Verständnis der zugrunde liegenden Ursachen der intraindividuellen Variabilität bei...

Elisabetta entwickelt ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK) Modell des direkten oralen Antikoagulans (DOAK) Rivaroxaban. Ziel ist es, unser Verständnis der zugrunde liegenden Ursachen der intraindividuellen...

Helen arbeitete an einem physiologiebasierten Modell von Pravastatin. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen von Genotypen sowie Leber- und Nierenerkrankungen auf die Pharmakokinetik von Pravastatin...

Nike entwickelt ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK) Modell des SGLT2-Hemmers Dapagliflozin. Ziel ist es, unser Verständnis der zugrunde liegenden Ursachen der intraindividuellen Variabilität bei der...

Isabella entwickelt ein PBPK/PD-Modell des GLP-1-Rezeptoragonisten Liraglutid, um dessen pharmakologisches Verhalten und Auswirkungen auf die Glukosehomöostase zu untersuchen, mit Schwerpunkt auf individualisierten Behandlungsstrategien.

Am Program Day der Humboldt-Universität zu Berlin präsentierten Isabella Tan, Olivia Yau und Minjun Kim ihre physiologiebasierten pharmakokinetischen/pharmakodynamischen (PBPK/PD) Modellierungsprojekte zu GLP-1-Rezeptoragonisten. Minjun Kim...

Rohini unterstützt die Datenkuratierung für die Pharmakokinetik von Morphin.

Rohit unterstützt die Datenkuratierung für die Pharmakokinetik von Morphin.

Emre arbeitet an CySBML Reloaded: Smarter, Simpler, Automated, einem Projekt zur Weiterentwicklung von CySBML - einer Cytoscape-App zur Visualisierung computergestützter Modelle, die in SBML...

Michael Gaas erweitert die Systems Biology Simulation Core Library (SBSCL) durch die Entwicklung eines solverunabhängigen Frameworks, das die nahtlose Integration von Open-Source- und kommerziellen...

Abhinav entwickelt ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches (PBPK) Modell des GIP- und GLP-1-Rezeptoragonisten Tirzepatid (Mounjaro). Ziel ist es, unser Verständnis der zugrunde liegenden Ursachen der intraindividuellen...

Yusuf arbeitet an einem physiologiebasierten pharmakokinetischen/pharmakodynamischen Modell des direkten Reninhemmers Aliskiren.

Luca arbeitet an einem physiologiebasierten Modell der oralen Kontrazeptivum-Komponente Ethinylestradiol. Am Ende dieses Projekts bieten wir ein robustes und validiertes PBPK-Modell für Ethinylestradiol, das...

Jennesse entwickelt ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK) Modell des SGLT2-Hemmers Canagliflozin. Ziel ist es, unser Verständnis der zugrunde liegenden Ursachen der intraindividuellen Variabilität bei der...

Deepa arbeitete an einem kinetischen Modell der glukosestimulierten Insulinsekretion (GSIS) der pankreatischen Betazelle und untersuchte Veränderungen der Glykolyse während der Insulinsekretion sowie später die...

Beatrice arbeitet an einem physiologiebasierten Modell zur Charakterisierung des intestinalen P-Glykoproteins unter Verwendung von Talinolol als Sondensubstanz.

Vera entwickelte ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches/pharmakodynamisches (PBPK) Modell des SGLT2-Hemmers Canagliflozin. Ziel ist es, unser Verständnis der zugrunde liegenden Ursachen der intraindividuellen Variabilität bei der...

Samira arbeitet daran, unser Verständnis der Rolle von Endoglin in der TGF-β-Signalübertragung zu vertiefen. Sie entwickelt ein computergestütztes Modell, das die Feinheiten der Rolle...

Jonas arbeitete an einem physiologiebasierten Modell von Chlorzoxazon für die hepatische CYP2E1-Phänotypisierung. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen von CYP2E1-Induktion/-Inhibition und Zonierung auf die Chlorzoxazon-Phänotypisierung....

Prerna arbeitete an einem fortgeschrittenen großen Sprachmodell (LLM), das als Expertensystem für die effiziente und präzise Kuratierung pharmakokinetischer Daten aus der wissenschaftlichen Literatur dient.

Afruja arbeitete an einem systematischen Überblick über die Proteinvariabilität von Cytochrom-P450-(CYP450)-Isoformen in der menschlichen Leber.

Hannah wird einen pharmakokinetischen Datensatz für Semaglutid erstellen und eine erste Version eines physiologiebasierten pharmakokinetischen (PBPK) Modells des GLP-1-Hemmers Semaglutid entwickeln. Ziel ist es,...

Huelya wird ein physiologiebasiertes pharmakokinetisches (PBPK) Modell des ACE-Hemmers Captopril entwickeln.

Frances arbeitet an einem physiologiebasierten pharmakokinetischen (PBPK) Modell von Sorafenib für die systemische Behandlung des hepatozellulären Karzinoms (HCC). Zentrale Fragestellungen sind die Untersuchung der...

Sankha arbeitete an der Analyse und Quantifizierung von Mikrozirkulationsdaten, die bei Menschen und Ratten erfasst wurden, und entwickelte einen Workflow für die Analyse von...

Xenia arbeitet an einem physiologiebasierten pharmakokinetischen (PBPK) Modell von Inulin zur Bestimmung der glomerulären Filtrationsrate (GFR). Unser Ziel ist es, ein tieferes Verständnis der...

Zahra arbeitet an einem physiologiebasierten pharmakokinetischen (PBPK) Modell zur Schätzung der glomerulären Filtrationsrate (eGFR) mittels Kreatinin. Ziel ist es, unser Verständnis dafür zu vertiefen,...

Adrian arbeitete an einem physiologiebasierten Modell der Indocyaningrün-(ICG)-Clearance. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen von Blutfluss und Plasmaproteinen auf die ICG-Clearance und damit verbundene Leberfunktionstests....

Nurudeen arbeitet an einem physiologiebasierten pharmakokinetischen (PBPK) Modell des Kontrastmittels Gd-EOB-DTPA. Zentrale Fragestellungen sind die Untersuchung der Auswirkungen von hepatorenaler Funktionsstörung, Perfusion und OATP-Aktivität...

Jan arbeitete an der Stratifizierung und Personalisierung computergestützter Modelle. Er entwickelt Methoden und Software für die halbautomatische Datenkuratierung pharmakokinetischer Informationen sowie eine pharmakokinetische Datenbank...

Sophie arbeitete an einem systematischen Überblick über die Proteinvariabilität von ABC- und SLC-Transportern in der menschlichen Leber.

Paula arbeitet an einem Pharmakokinetik-/Pharmakodynamik-Modell von Metoprolol. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen von Dosierung und Formulierung auf die Pharmakokinetik von Metoprolol und die Reduktion...

Janosch arbeitet an der computergestützten Modellierung von Paracetamol in der Leber und kuratiert Daten für die Pharmakokinetik-Datenbank PK-DB.

Sükrü Balci arbeitet an einem physiologiebasierten Modell von Omeprazol. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen von Formulierung und Dosierung von Omeprazol auf dessen pharmakodynamische Wirkungen.

Yannick Duport arbeitet an einem physiologiebasierten Modell der Midazolam-Clearance. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen von Hemmstoffen und Induktoren auf den Metabolismus von Midazolam.

Danny Ke arbeitet an einem physiologiebasierten Modell von Benzodiazepinen. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen genetischer Variabilität auf die Clearance von Diazepam.

Florian arbeitet an einem physiologiebasierten Modell der Statin-Clearance. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen von Statinen (Atorvastatin und Simvastatin) auf die Cholesterin-Plasmaspiegel und Arzneimittelinteraktionen.

Sara de Angelis arbeitet an einem physiologiebasierten Modell von Torasemid. Zentrale Fragestellungen sind die Auswirkungen des Geschlechts auf die Pharmakokinetik und -dynamik von Torasemid.

In Zusammenarbeit mit Andreas Dräger von der Universität Tübingen erweitern wir die SBML- und JSON-Unterstützung für cobrapy. Der vollständige Projektvorschlag ist hier verfügbar.

In Zusammenarbeit mit Andreas Dräger von der Universität Tübingen erweitern wir die SBML-Unterstützung für The Systems Biology Simulation Core Library. Der vollständige Projektvorschlag ist...

In Zusammenarbeit mit Andreas Dräger von der Universität Tübingen arbeiten wir an der Erweiterung von ModelPolisher zu einem universellen Annotationswerkzeug.

Patrick arbeitet an der Analyse der zirkadianen Uhr von Säugetieren in der menschlichen Leber auf Basis der Analyse von OMICS-Datensätzen.

Im Rahmen seiner Abschlussarbeit wurde das Konzept einer Modular Research Environment (MRE) entwickelt. Eine MRE ist ein modulares Anwendungsframework, das durch Plugins zu einem...

Die Systems Biology Simulation Core Library (SBSCL) bietet eine effiziente und umfassende Java™-Implementierung von Methoden zur Interpretation des Inhalts von Modellen, die in der...

Im Rahmen dieses Projekts wurde als Teil des Google Summer of Code 2017 eine Web-App für SBML-Modelle implementiert, die Funktionen für Zeitverlaufssimulation, Steady-State-Analyse und...

Dimitra (Master Toxikologie) arbeitete an der Analyse und Digitalisierung von Literaturdaten für Leberfunktionstests.